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SETDB1靶向药物的开发现状
发布时间:2025-08-04 09:16:35基因表达调控是生命活动的核心机制之一,其中翻译后组蛋白修饰对基因表达模式的塑造具有关键作用,其异常与癌症等重大疾病的发生发展密切相关,已成为临床诊断与治疗干预的重要研究对象。甲基转移酶SETDB1介导的组蛋白赖氨酸甲基化修饰,作为基因表达调控网络中的重要环节,在多种恶性肿瘤中呈现异常激活状态,通过调控下游靶基因表达参与肿瘤细胞增殖、侵袭及耐药等生物学过程。针对SETDB1的靶向药物研发,已成为当前生物医药领域探索恶性肿瘤治疗新策略的重要方向。
SETDB1与癌症的复杂关联
SETDB1在大多数癌症类型中呈现过表达状态,犹如给肿瘤发展“添柴加薪”。例如在肺腺癌高转移亚系中,SETDB1表达受损时却展现出抗癌作用;在结直肠癌细胞里,它又被证明是细胞生长抑制剂,能阻断G1-S细胞周期转化。在卵巢浆液性癌中,高环状SETDB1RNA水平与晚期临床阶段、淋巴结转移等不良预后相关联。在转移性和高危原发性黑色素瘤中,SETDB1高表达与较差预后挂钩。在白血病中,SETDB1介导的H3K9甲基化影响疾病进展。在脑肿瘤、乳腺癌、胰腺癌等多种癌症中,SETDB1也通过不同机制,或促进肿瘤生长,或影响肿瘤细胞对化疗药物的反应。它宛如一把双刃剑,在不同癌症情境下发挥着复杂作用,也正因如此,成为极具潜力的癌症治疗靶点。
现有药物研发的探索与困境
目前,影响SETDB1功能的药物研发方向主要集中在SET-domainHMT抑制剂、H3K9甲基化抑制剂以及miRNAs等领域。在肺癌细胞研究中,甲基转移酶抑制剂DZNep能降低H3K9me3水平和SETDB1表达,促进肺癌细胞凋亡并减少细胞生长。在非小细胞肺癌中,miR-29与SETDB1表达呈负相关,提示其作为潜在治疗靶点的可能性。还有天然生物碱化合物Piperlongumine,可降低肺癌细胞株中SETDB1表达,诱导癌细胞死亡。一些已批准的化疗药物,如紫杉醇、顺铂和阿霉素等,也被发现与SETDB1存在关联。
然而,SETDB1靶向药物开发之路布满荆棘。一大难题在于,目前用于临床前测试的SETDB1抑制剂大多为非选择性化合物。由于SETDB1的SET结构域是分裂的,且尚无晶体结构报道,开发特异性的SETDB1小分子抑制剂困难重重。不过,科研人员并未就此却步,将目光投向SETDB1的其他结构域,如SETDB1-TTD结构域,期望从这里打开突破口。
新型靶向药物的曙光
2021年,研究人员通过逐步的结构引导优化,发现了首个强效且选择性的小分子SETDB1-TTD抑制剂(R,R)-59,其在ITC测定中展现出0.088±0.045μm的KD值,为靶向SETDB1-TTD结构域的药物开发带来希望。2024年,清华大学药学院饶燏团队等揭示了Smurf1介导的磷酸肌苷依赖性蛋白激酶1(PDK1)类化修饰在PI3K-Akt信号传导和肿瘤发生中的重要作用,并利用新的PROTAC开发策略,获得了针对Smurf1的高效降解剂SMART1。在这一过程中,发现多神经前细胞表达发育下调的蛋白8募集甲基转移酶SETDB1参与其中,为SETDB1靶向药物开发提供了新的作用机制思路。此外,还有研究致力于开发靶向SETDB1-TTD结构域的小分子抑制剂,实验表明这类化合物对SETDB1-TTD结构域具有良好亲和活性,能竞争性靶向抑制其对底物蛋白的识别,有望用于治疗与SETDB1表达异常相关的多种疾病。
SETDB1在癌症发生发展中的复杂作用机制及其作为潜在治疗靶点的研究价值已日益凸显。尽管当前SETDB1靶向药物的研发仍面临诸多技术瓶颈与挑战,但随着生命科学与药学研究的不断深入,以及多学科交叉合作的持续推进,相关研究已取得了一系列阶段性成果,并为未来的发展奠定了坚实基础。

